馬來西亞擁有許多自然景觀，即使是最富有經驗的探險老手也能在此尋獲滿足。其中有超過百分之五十的土地仍為森林所覆蓋。這些熱帶森林是世界上最珍奇的花卉植物和動物的最後堡壘。世界上最大的花卉萊佛士花(Rafflesia)以及最細小的侏儒松鼠都能在這裡找到。為了保存這大自然的遺產以傳給後世，國家公園早在前半世紀經已成立。
京那峇魯國家公園 – 沙巴
京那峇魯國家公園面積為754平方公尺，包括高達海拔4,093公尺的京那峇魯山，這是全東南亞最高的山。這座公園可算是奇珍植物及動物的家園，其中包括萊佛士花(Rafflesia)及Nepenthes(囊葉植物)以及逾1,000種的野胡姬。野生動物有婆羅洲山簏特有的松鼠，紅色頸項而背部扁平的蛇，與及許多不同品種的鳥類，如Friendly Kinabalu Warbler等。遊人更可順道到訪波靈溫泉，浸泡個通快。
巴咯國家公園 – 砂勞越
砂勞越西部的巴咯國家公園是一座小型的公園，佔地26平方公里，位於巴咯河的出口巴咯國家公園以其多姿多彩的大自然怡人景色而聞名，這兒擁有隱蔽的港灣，多岩的陸岬以及沙岩懸崖。懸崖底部還有被海水沖刷而成的海蝕拱和海蝕柱。此外，公園還擁有七種生態地區，包括混合的低地Dipterocarp森林以及高地沙漠矮樹叢。
姆魯山國家公園 – 砂勞越
這是砂勞越最大的國家公園，佔地544平方公尺。公園擁有非常龐大的地下岩洞系統，是世界上最大的岩洞之一。這個被列為聯合國教科文組織世界遺產的洞穴，相信是全世界最大的洞穴山脈。在這個石灰岩山脈下，發現有地下河系統及特大型的洞穴通道
彩洞
擁有千多年歷史，洞內發現有遠至鐵器時代的彩色壁畫。
除了洞穴探索外，遊客還可攀登約400公尺高的石灰岩山峰。公園內設有林間小屋、旅舍、洗手間及餐廳。
尼亞洞 / 巨洞
1873年，巨洞內發現有史前人類活動的遺跡。現今已成為卑南族採集珍貴的燕窩及海燕糞便之地。
尼亞國家公園 – 砂勞越
砂勞越尼亞國家公園是由3,103公頃的森林與石灰岩組成，並以珍貴的洞穴聞名，其中包括尼亞洞(巨洞)及彩洞等。
